我国科学家开发新型mirna-pg电子游戏麻将胡了
- 发布日期:2019-12-24
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2019年10月8号,北京大学基础医学院周源团队和河北工业大学李建伟团队合作在genome biology上在线发表了题为benchmark of computational methods for predicting microrna-disease associations的文章。该研究测试结果不仅为生物医学研究人员选择合适的mirna-疾病关联预测因子提供了参考,还为开发更强大的mirna-疾病关联预测因子提供了未来的方向。
microrna(mirna)是22nt左右的rna,主要通过靶向mrna的3‘utr区来调节基因表达。这些小的非编码rna广泛参与重要的生物学过程,例如细胞分裂,分化,凋亡,细胞周期调节,炎症和应激反应。因此,mirna的失调,包括表达失调,功能获得或丧失的突变以及表观遗传沉默,通常在许多疾病的发作和发展中起重要作用。
本研究基于来自最新hmddv3.1数据库的8000多种新颖的mirna疾病关联,对36种容易获得的预测方法进行了系统比较。通过严格的精确召回曲线分析对它们的整体性能进行了评估,其中有13种方法显示出可接受的准确性(auprc 0.200),而前两种方法的auprc则有希望达到0.300以上。通过组合不同的预测变量或采用更新的mirna相似度矩阵证明了性能提高的潜力,与最佳的单个预测变量和使用先前相似性矩阵的预测变量相比,分别可提高auprc的16%和46% 。
该基准测试结果不仅为生物医学研究人员选择合适的mirna-疾病关联预测因子提供了参考,还为开发更强大的mirna-疾病关联预测因子提供了未来的方向。
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